เป็นภาพยนตร์แอนิเมชันที่สร้างจากมังงะชื่อดัง เล่าเรื่องราวของ ซาเอบะ เรียว นักสืบเอกชนและมือปืนผู้มีชื่อเสียงในเขตชินจูกุ ที่มีทักษะการยิงปืนเป็นเลิศ แต่ก็ขึ้นชื่อเรื่องความเจ้าชู้จนมักโดนคู่หูของเขา มาคิมุระ คาโอริ ลงโทษด้วยค้อนยักษ์ในตำนาน

ในภารกิจครั้งนี้ เรียวและคาโอริได้รับมอบหมายให้คุ้มครอง ชินโด ไอ หญิงสาวผู้ว่าจ้างที่ตกเป็นเป้าหมายของกลุ่มโจรก่อการร้ายที่ต้องการลักลอบเอาข้อมูลสำคัญที่เกี่ยวข้องกับแผนการร้ายระดับชาติ ขณะที่ปกป้องชินโด ไอ คาโอริได้พบกับ มิคุนิ ชินจิ เพื่อนสมัยเด็กของเธอ ซึ่งกลายมาเป็นศัตรูหัวใจของเรียว และมีส่วนเกี่ยวข้องกับแผนการร้ายในครั้งนี้

ด้วยการต่อสู้ที่เต็มไปด้วยแอ็กชัน การไล่ล่า และความสัมพันธ์ที่ซับซ้อนระหว่างตัวละคร City Hunter: Shinjuku Private Eyes สร้างความสนุกสนานและระทึกใจ พร้อมกับมุกตลกที่เป็นเอกลักษณ์ของซีรีส์